Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18528 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18528 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18528 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18528 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18528 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms