Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms