Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mtatp6P00848 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mtatp6P00848 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mtatp6P00848 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mtatp6P00848 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms