Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChkbO55229 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms