Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms