Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LatO54957 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LatO54957 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LatO54957 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LatO54957 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LatO54957 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LatO54957 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LatO54957 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LatO54957 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LatO54957 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LatO54957 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LatO54957 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LatO54957 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LatO54957 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms