Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms