Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xbp1O35426 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms