Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms