Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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