Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Cldn4O35054 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Cldn4O35054 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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