Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm19965J3QNY8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm19965J3QNY8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Gm19965J3QNY8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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