Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21411J3KMS0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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