Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms