Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms