Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6J4

Ceacam3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam3E9Q6J4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ceacam3E9Q6J4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms