Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms