Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5934D3Z4U6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5934D3Z4U6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms