Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms