Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms