Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms