Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SetxA2AKX3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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