Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms