Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNZ6

1700025B11Rik, RIKEN cDNA 1700025B11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms