Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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