Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms