Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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