| CTXN3 | Q4LDR2 | SAR1AP4-201 | ENST00000429225 | 591 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC087499.2-201 | ENST00000432861 | 149 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL844175.1-201 | ENST00000455153 | 323 nt | TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007547.1-201 | ENST00000462177 | 490 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC021491.3-201 | ENST00000513378 | 156 nt | TSL 3 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SKP132-201 | ENST00000516001 | 208 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SKP282-201 | ENST00000516824 | 299 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ACA59.2-201 | ENST00000517061 | 156 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | IGHVII-62-1-201 | ENST00000519283 | 235 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP001783.1-202 | ENST00000534620 | 408 nt | TSL 2 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090772.1-201 | ENST00000583782 | 507 nt | TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BNIP3P25-201 | ENST00000596023 | 559 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC024153.1-201 | ENST00000603103 | 365 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC006023.1-201 | ENST00000603944 | 259 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC091152.3-201 | ENST00000604227 | 325 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | APOOP1-201 | ENST00000604695 | 592 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC123912.5-201 | ENST00000605470 | 343 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL357078.3-201 | ENST00000607528 | 618 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC006504.8-201 | ENST00000621046 | 635 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Z69720.2-201 | ENST00000624755 | 279 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DNAJC2-201 | ENST00000249270 | 1846 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LPP-221 | ENST00000618621 | 18277 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LPP-222 | ENST00000640853 | 18277 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | THNSL1-201 | ENST00000376356 | 3691 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PLS1-201 | ENST00000337777 | 3755 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GCNT4-201 | ENST00000322348 | 5554 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.86-201 | ENST00000363020 | 111 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EYS-204 | ENST00000370621 | 10485 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL162578.1-201 | ENST00000406202 | 378 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NT5C3A-205 | ENST00000409467 | 1032 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009161.1-201 | ENST00000417306 | 376 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL31P12-201 | ENST00000422587 | 358 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PTGES3P4-201 | ENST00000426243 | 356 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL136234.1-201 | ENST00000437080 | 349 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGB1P31-201 | ENST00000437242 | 427 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01650-201 | ENST00000438093 | 602 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | IFT74-AS1-201 | ENST00000456198 | 405 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MRPL42P6-201 | ENST00000486397 | 371 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AKIRIN2P1-201 | ENST00000505898 | 352 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC023050.3-201 | ENST00000541142 | 333 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC138761.3-201 | ENST00000579993 | 334 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BX546450.2-201 | ENST00000602419 | 435 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-85P-201 | ENST00000605989 | 107 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090617.7-201 | ENST00000623952 | 126 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CUL3-203 | ENST00000409096 | 2701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01416-201 | ENST00000563553 | 2310 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PCAT4-201 | ENST00000504263 | 2091 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CASC19-280 | ENST00000642102 | 1351 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC138393.1-203 | ENST00000327086 | 343 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU5E-7P-201 | ENST00000365290 | 117 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1283P-201 | ENST00000365314 | 105 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BTLA-202 | ENST00000383680 | 726 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA46-201 | ENST00000384762 | 135 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL512633.1-201 | ENST00000399931 | 655 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL7P10-201 | ENST00000417407 | 739 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC005482.1-201 | ENST00000420758 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL139413.1-201 | ENST00000421309 | 217 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL7P37-201 | ENST00000425095 | 738 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009296.1-201 | ENST00000443146 | 155 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OSTCP8-201 | ENST00000445117 | 448 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC006026.2-201 | ENST00000457376 | 180 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GZMAP1-201 | ENST00000503054 | 631 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC018710.1-201 | ENST00000506509 | 158 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC098799.2-201 | ENST00000509466 | 868 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1069P-201 | ENST00000516612 | 133 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MDM2-221 | ENST00000517852 | 393 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-323P-201 | ENST00000521915 | 107 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP001189.6-201 | ENST00000528781 | 831 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4513-201 | ENST00000581077 | 86 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BNIP3P10-201 | ENST00000605360 | 577 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CTHRC1P1-201 | ENST00000605383 | 469 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KCNQ1OT1_3.1-201 | ENST00000616504 | 116 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FAM214A-201 | ENST00000261844 | 4217 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01419-201 | ENST00000522365 | 1521 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-942P-201 | ENST00000363002 | 107 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.100-201 | ENST00000363141 | 102 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U3.12-201 | ENST00000364498 | 214 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR147B-201 | ENST00000390185 | 80 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL513477.1-202 | ENST00000417061 | 214 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL162726.4-201 | ENST00000422010 | 673 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL139281.1-201 | ENST00000422120 | 335 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093151.1-201 | ENST00000427711 | 313 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC107626.1-201 | ENST00000471084 | 183 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC105389.2-201 | ENST00000506475 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PRDX4P1-201 | ENST00000507189 | 574 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP94-201 | ENST00000512518 | 302 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008115.2-201 | ENST00000539988 | 241 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PSMA4-204 | ENST00000558094 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PSMA4-205 | ENST00000558281 | 773 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR5692C1-201 | ENST00000585309 | 91 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR1M4P-201 | ENST00000589199 | 287 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZRANB2-AS2-213 | ENST00000591654 | 719 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL391813.1-201 | ENST00000603098 | 260 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL12P50-201 | ENST00000603116 | 116 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGN5-201 | ENST00000358130 | 2126 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KIAA1107-202 | ENST00000636278 | 4065 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AK9-203 | ENST00000368948 | 2478 nt | TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ANKRD36BP1-201 | ENST00000358576 | 1779 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1252P-201 | ENST00000363054 | 104 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL354864.1-201 | ENST00000373226 | 539 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |