Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CLPPQ16740 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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