Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCBQ16585 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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