Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
TNXAQ16473 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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TNXAQ16473 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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TNXAQ16473 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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TNXAQ16473 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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TNXAQ16473 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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TNXAQ16473 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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TNXAQ16473 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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TNXAQ16473 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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TNXAQ16473 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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