Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFNB3Q15768 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFNB3Q15768 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFNB3Q15768 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFNB3Q15768 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFNB3Q15768 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFNB3Q15768 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFNB3Q15768 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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