Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms