Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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