Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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GPNMBQ14956 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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GPNMBQ14956 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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GPNMBQ14956 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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GPNMBQ14956 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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GPNMBQ14956 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GPNMBQ14956 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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