Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms