Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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