Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF2H2Q13888 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GTF2H2Q13888 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms