Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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