Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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ITGA9Q13797 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGA9Q13797 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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