Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
APOFQ13790 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
APOFQ13790 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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