| RUNX3 | Q13761 | AC004805.2-201 | ENST00000605382 | 482 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359547.2-201 | ENST00000615810 | 418 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024940.5-201 | ENST00000622889 | 474 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FER-210 | ENST00000628534 | 558 nt | TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z99571.1-201 | ENST00000636677 | 394 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ECT2-211 | ENST00000441497 | 2825 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CKAP2P1-201 | ENST00000555477 | 2049 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-799P-201 | ENST00000363567 | 107 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.390-201 | ENST00000383932 | 102 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL079342.1-201 | ENST00000401460 | 267 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FO393413.1-201 | ENST00000402892 | 195 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-387P-201 | ENST00000411331 | 105 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC099548.1-201 | ENST00000421443 | 426 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL080284.1-201 | ENST00000434493 | 442 nt | TSL 2 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137789.1-201 | ENST00000439443 | 682 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPM6BP1-201 | ENST00000446387 | 144 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL12P25-201 | ENST00000455592 | 494 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC133134.1-201 | ENST00000466800 | 359 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | CCDC34P1-201 | ENST00000507441 | 517 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMAD1-AS2-201 | ENST00000508936 | 1090 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02061-201 | ENST00000514225 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP165-201 | ENST00000517142 | 115 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SKP1-203 | ENST00000517625 | 876 nt | APPRIS P4 TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC124657.1-201 | ENST00000527819 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084851.1-201 | ENST00000529105 | 249 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELOCP31-201 | ENST00000540463 | 467 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLEC2D-214 | ENST00000543300 | 399 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLEC2D-216 | ENST00000545918 | 288 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIF1AP1-201 | ENST00000553642 | 175 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133241.1-201 | ENST00000556832 | 487 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020661.3-201 | ENST00000558101 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL138976.2-201 | ENST00000563989 | 694 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001094.1-201 | ENST00000579805 | 193 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006504.5-204 | ENST00000592404 | 765 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023043.3-201 | ENST00000593113 | 385 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL162413.1-201 | ENST00000603198 | 110 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BNIP3P9-201 | ENST00000603714 | 553 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104458.1-201 | ENST00000608243 | 463 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U2.21-201 | ENST00000637295 | 81 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP006437.1-201 | ENST00000641440 | 3685 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGF7-201 | ENST00000267843 | 5467 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL33-203 | ENST00000456383 | 2501 nt | TSL 5 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SERPINI2-202 | ENST00000461846 | 1514 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LIPI-203 | ENST00000536861 | 1529 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.295-201 | ENST00000364918 | 102 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-116P-201 | ENST00000384042 | 109 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR221-201 | ENST00000385135 | 110 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR9R1P-201 | ENST00000412200 | 877 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C66P-201 | ENST00000414917 | 930 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011243.1-201 | ENST00000420184 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018634.1-201 | ENST00000437554 | 401 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL714022.1-201 | ENST00000439897 | 151 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DPPA3P1-201 | ENST00000448050 | 469 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GSTA11P-201 | ENST00000452866 | 669 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU13.28-201 | ENST00000459235 | 104 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-180P-201 | ENST00000459240 | 63 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01326-201 | ENST00000495159 | 755 nt | TSL 2 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099520.1-206 | ENST00000523434 | 486 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HTN3-202 | ENST00000526767 | 578 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADI1P3-201 | ENST00000549509 | 470 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL118558.2-201 | ENST00000556294 | 238 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA59B-202 | ENST00000578183 | 701 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTN-AS1-212 | ENST00000582847 | 1036 nt | TSL 5 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4424-201 | ENST00000585257 | 86 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005357.2-201 | ENST00000586473 | 583 nt | TSL 2 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BNIP3P10-201 | ENST00000605360 | 577 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C8orf59-208 | ENST00000612809 | 475 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002064.3-201 | ENST00000623448 | 346 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024614.3-201 | ENST00000637860 | 256 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IDE-201 | ENST00000265986 | 5877 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NEDD1-204 | ENST00000457368 | 3162 nt | TSL 2 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099654.7-201 | ENST00000635788 | 2127 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR51A7-202 | ENST00000641490 | 2186 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EDDM3A-201 | ENST00000326842 | 927 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.481-201 | ENST00000384373 | 102 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ59-201 | ENST00000390480 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR888-201 | ENST00000401186 | 77 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000473.1-201 | ENST00000413645 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL109914.1-201 | ENST00000414740 | 146 nt | TSL 5 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00428-201 | ENST00000415620 | 227 nt | TSL 5 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160275.3-201 | ENST00000423876 | 471 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SKA2P1-201 | ENST00000425592 | 390 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02263-203 | ENST00000426240 | 515 nt | TSL 5 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079799.1-201 | ENST00000430696 | 331 nt | TSL 3 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL36AP53-201 | ENST00000432891 | 316 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL033504.1-204 | ENST00000434985 | 413 nt | TSL 2 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P31-201 | ENST00000437242 | 427 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEPT14P3-201 | ENST00000439401 | 183 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |