Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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