Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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