Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATRQ13535 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATRQ13535 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATRQ13535 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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