Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BFSP2Q13515 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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