Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGB3BPQ13352 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms