Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms