Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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