Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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IFT88Q13099 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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IFT88Q13099 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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