Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDC16Q13042 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms